Nato a Trieste nel 1950, si laurea in Architettura a Venezia, sotto la guida di Carlo Scarpa .
Ha curato per il Comune di Torino la mostra "Vetro Italiano 1920-1940".

Nel 1984 è stato nominato consulente capo per la mostra "The Venetians" tenutasi alla Karasik Gallery di New York.
Nel 1989 Allemandi pubblica il libro I Vetri di Venini, al quale seguiranno nel 1997 Murano '900 - Vetri e Vetrai , e ancora nel 2007 I vetri Venini. La storia, gli artisti, le tecniche, 1921-2007 , in due volumi.
Nel 1996 inizia la propria produzione di vetri artistici.
Nel dicembre 2012 Allemandi pubblica Fontana Arte - Giò Ponti , Pietro Chiesa , Max Ingrand.
Nel 2015 in collaborazione con la milanese Gabriella Crespi, crea il tavolo puzzle 4H (e), in soli due esemplari, uno con piano in vetro rosso e l'altro blu. Il tavolo scultura riprende il modello della serie Plurimi di Gabriella Crespi, i profili sono in ottone e il prezioso vetro puzzle del piano è stato realizzato personalmente da Franco Deboni in una fornace di Murano.
Opere di Franco Deboni si trovano al Museo del Vetro di Murano, a Rotterdam e negli Stati Uniti. La Galleria Rita Fancsaly di Milano, oltre a diverse opere di Gabriella Crespi, espone una considerevole collezione di vasi artistici di Franco Deboni.
Deboni collabora con Case d'Aste, Musei e Fondazioni in tutto il mondo. E' esperto del settore vetrario per la Federazione Italiana Mercanti d'Arte.
Nel tempo ha prodotto numerose pubblicazioni sulle arti decorative del Novecento in collaborazione con le maggiori riviste d'arte.

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